В ноябре 2009 года железнодорожный пассажирский перевозчик «ТрансКлассСервис» прошел сертификацию системы менеджмента качества на соответствие требованиям международного стандарта ISO 9001:2008. Сертификат соответствия подтверждается ежегодно.
С 2009 года все проводники «ТКС» проходят базовую подготовку (однократно) и курсы повышения квалификации (1 раз в три года) в учебно-методическом центре «Экспресс» по программам, утвержденным Федеральной пассажирской компанией.
В июле 2010 года с целью осуществления обучения и повышения квалификации линейного и управляющего персонала в компании создан собственный учебный центр «ТКС». Повышение квалификации линейного персонала осуществляется в соответствии с программами.